La leyenda describe el nacimiento de Merlín como el resultado de los poderes del infierno en un intento de dar a luz a un niño satánico pero algo fue mal y surgió un individuo variopinto y ambiguo que se empeñó en seguir su propio camino. 

Sin embargo, el niño conservó poderes místicos y profetizó. Por ejemplo, a los cinco años visitó la corten del rey Vortirgen y predijo la batalla entre los dragones rojos y blancos que acabaría con la muerte del Rey.

Unos años después utilizó su magia para transportar, a petición del rey Aurelius, Stonehenge desde Irlanda hasta su actual emplazamiento en la llanura de Salisbury y ayudó al siguiente rey, Uther Pendragon, en un asunto más personal cuando transformó el aspecto externo del Rey para seducir a la mujer que deseaba. De esa unión nació el rey Arturo.

Merlín jugó un importante papel en la educación de Arturo y fue quien propuso la utilización de la mesa redonda para reuniones de manera que los caballeros no se pelearan por un lugar más preeminente que otro.

Merlín encontró su pareja mágica en la bruja Nimue, de la que se enamoró. Ella le superó y, con la ayuda de uno de sus encantamientos, lo encerró en una cueva, en la que todavía languidece.